Přesto, že má soubojový systém klasických japonských RPG ve své původní podobě spoustu fanoušků, po těch dvaceti letech, kdy se téměř beze změn používá, je dnes značně vyčpělý.

Úžasnou inovaci přinesla hra Final Fantasy XII. Její odkaz však nejen že nepřevzala konkurence, ale vypadá to, že ani samotný Square-Enix.

Několik prvků systému Final Fantasy XIII:

Command Stock: Výběr akce z předpřipravených pěti akčních slotů. Cost: Každá z akcí má určité číslo, které označuje počet slotů, které daná akce požaduje.
Enhanced ATB (Active Time Battle): Každá postava má tentokrát určitý počet bodů, reprezentovaný proužkem pod jménem. Postavy mohou provádět akce, dokud se jim nedojdou akční body.
Symbol Encounter: Nepřátelé jsou vidět na mapce.
Chain & Bonus: Chain označuje počet po sobě jdoucích zásahů. Možná bude fungovat jako ve Final Fantasy XII, kdy se počítaly zásahy do stejného druhu nepřítele. Bonus je zatím nejasná položka, ale Famitsu se domnívá, že bude fungovat podobně jako Limit Break ve Final Fantasy VII.
Enemy HP: Přímo v boji (bez použití speciálních předmětů a magie) vidíte počet HP a jména vašich nepřátel, což je poprvé v sérii Final Fantasy.