Pokračoval tedy v politickém důchodu, který se rozhodl trávit v chalupě na Vysočině. S ČSSD zůstal po neúspěšné prezidentské volbě ve sporech. Tehdejší šéf socialistů Jiří Paroubek sice přijel v červenci roku 2006 za Zemanem na usmiřovací schůzku, ale následující rok Miloš Zeman z ČSSD vystoupil.
